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Fluidigm C1單細胞自動制備系統是一種基于微流控技術的創新性自動化設備，專為單細胞基因組學研究而設計。該系統能夠快速、可靠地分離單個細胞，并完成從捕獲到后續分析的全過程，包括細胞裂解、RNA提取、逆轉錄、cDNA合成及擴增等步驟。以下是關于該系統的詳細說明：
1. 技術原理與功能
C1系統的核心是集成微流控電路（Integrated Fluidic Circuit, IFC），通過微流控技術將單個細胞隔離到獨立的反應腔中。每個反應腔可以捕獲5-10微米至25微米大小的單個細胞，最多可同時處理96個單細胞。在捕獲后，系統自動進行細胞裂解、RNA反轉錄和cDNA擴增，生成用于后續分析的基因組文庫或轉錄組文庫。
2. 應用領域
C1系統廣泛應用于單細胞基因表達分析、全基因組測序、單細胞mRNA測序、全轉錄組研究以及表觀遺傳學研究等領域。它能夠幫助研究人員探索細胞異質性、識別稀有細胞、研究細胞功能以及驗證疾病相關生物標志物等。
3. 優勢
- 一體化自動化流程：C1系統實現了從單細胞捕獲到基因組分析的全流程自動化，減少了人為操作誤差，提高了實驗效率和數據準確性。
- 高通量與高精度：單張芯片可同時捕獲并處理多達96個單細胞，且捕獲效率高，能夠有效減少樣本污染和交叉污染。
- 適用范圍廣：支持多種細胞類型，包括細菌、真菌、植物細胞以及哺乳動物細胞等。
- 數據質量高：由于自動化程度高，實驗誤差大幅降低，生成的數據具有較高的可靠性和準確性。
4. 操作流程
C1系統的操作流程如下：
- 樣本準備：將細胞懸液加入到預加載的ICF芯片中。
- 單細胞捕獲：通過微流控技術將單個細胞捕獲到獨立的反應腔中。
- 細胞裂解與RNA提取：在捕獲后，系統自動裂解細胞并提取RNA。
- 逆轉錄與cDNA合成：將RNA逆轉錄為cDNA。
- 擴增與文庫構建：對cDNA進行擴增，生成用于測序的文庫。
- 后續分析：將生成的文庫導入高通量測序平臺進行基因組或轉錄組分析。
