上海辰山植物園(上海辰山植物科學研究中心)于2018年利用專項經(jīng)費購置了Oxford Nanopore公司出品的納米孔測序儀GridION X5,并于12月10日完成安裝調試和初級培訓工作,即將投入使用。
12月10日上午,特邀中國科學院植物逆境研究中心張蘅研究員、與實驗室工作人員、儀器安裝和培訓工程師一同開箱清點合同約定的供貨內容并開機測試,確認貨物齊備、儀器完好。12月10日下午,工程師對儀器技術和基礎應用、數(shù)據(jù)處理等進行了培訓,20余人參與。GridION能夠在48小時內生成100 Gb的數(shù)據(jù),并具有全面的數(shù)據(jù)處理能力。GridION X5系統(tǒng)的測序部分包含五個流動槽。這些流動槽可單獨使用或協(xié)同使用,并通過USB連接到計算機。與所有的納米孔測序一樣,它沒有固定的運行時間。計算機可以控制五個流動槽。系統(tǒng)運行新一代的GPU以及Linux操作系統(tǒng)。此外,納米孔核酸測序儀是目前唯一一類能對核酸分子本身進行實時數(shù)據(jù)測定和分析的核酸測定儀,即無需進行PCR或DNA酶合成等過程,因而可以減小誤差,真實反映核酸分子序列的情況,且不受核酸分子長度的影響,目前單條測定能達到2.5Mb長度。
該儀器將在服務于辰山科研中心各課題組的研究需要的同時通過上海研發(fā)公共服務平臺向社會共享服務。
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